Pour éviter des catastrophes lors d'accès fréquent via votre logiciel de montage ou de compositing à des séquences d'images ou à des vidéos HD qui nécessitent beaucoup de ressources pour les afficher impeccablement, Microsoft propose via Sysinternals un logiciel appelé Contig, qui s'execute sur Windows via la fenêtre DOS Command (CMD), et qui vous permet de défragmenter les fichiers de votre projet, sans défragmenter tout votre disque. Pour télécharger Contig : http://technet.microsoft.com/fr-fr/sysinternals/bb897428(en-us).aspx

Je vous conseille de placer l'executable Contig.exe dans votre répertoire Windows/system32 pour que vous puissiez y accèder de n'importe ou, sans avoir à la placer systématiquement dans votre répertoire dans lequel se trouvent vos fichiers à défragmenter.

Les commandes sont entre autres :

analyser un fichier et connaitre sa fragmentation : contig.exe -a "votre_fichier"
défragmenter un fichier en affichant les étapes de traitement : contig.exe -v "votre_fichier"
défragementer un répertoire complet en affichant les étapes : contig.exe -v -s "votre_répertoire"